Der Shimadzu PPSQ ist ein Instrument zur N-terminalen Bestimmung der Aminosäuresequenzen von Proteinen und Peptiden. Für diese Analyse werden in mehreren Reaktionszyklen einzelne Aminosäuren über den Edman-Abbau vom Molekül abgespalten. Diese Reaktionen finden automatisiert im PPSQ-Sequenzierungsmodul statt.  Im Anschluss wird die derivatisierte Aminosäure durch Hochleistungsflüssigkeitschromatographie (HPLC) analysiert und über die Retentionszeit identifiziert.

Vorteile der Verwendung des Edman-Abbaus für die Aminosäuresequenzierung

(1) Garantierte N-terminale Sequenz von Proteinen
(2) Keine Vorbehandlung der Probe erforderlich
(3) Differenzierung isobarer Aminosäuren (Leucin und Isoleucin)
(4) Identifizierung auch von unbekannten, nicht in Datenbanken registrierten Proteinen möglich

 

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Im Edman-Reaktionsmodul werden die Aminosäuren der Reihe nach vom N-Terminus eines Proteins durch wiederholten Edman-Abbau abgespalten und derivatisiert. Als Ergebnis werden stabile PTH-Aminosäuren hergestellt. Die PTH-Aminosäuren werden online in die HPLC injiziert, und die Analyse wird durchgeführt. Die HPLC-Daten werden auf dem Messrechner oder im LabSolutions Datenbanksystem (erfüllt CFR Part 11) gespeichert. Im Anschluss können die Messdaten in der Datenverarbeitungssoftware LabSolutions PPSQ ausgewertet werden. Diese Software benutzt einen Algorithmus über den die Anwender*innen bei der Interpretation der Aminosäuresequenz unterstützt werden.
 

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